中国智能交通协会的最高权力机构是会员代表大会，理事会是会员代表大会的执行机构，在会员代表大会闭会期间，理事会领导协会开展日常工作，对会员代表大会负责。理事会设立常务理事会，在理事会闭会期间常务理事会对理事会负责。

秘书处是协会日常办事机构，下设综合管理部、科技服务部、业务发展部、咨询研究部、国际合作部。其中综合管理部负责日常行政办公、财务管理、人事管理、会员管理等工作。业务发展部负责活动组织、运作、协调，定期组织行业交流活动及开展有关合作；负责协会宣传工作，组织编写协会会刊、联络行业媒体、稿件传递和其他有关事项。科技服务部负责中国智能交通协会科学技术奖组织实施工作，为奖励征集、评审、公示、颁奖等工作提供支撑，组织开展行业科技成果评价、指标测评、科技论文等工作。咨询研究部负责为政府有关部门、行业、社会提供咨询服务；负责协会团体标准的研制工作；负责国内外智能交通相关数据信息的收集、整理、分析，以及统计数据信息对外、对内的统一管理。国际合作部负责与境外相关协会或组织、境外驻华机构间的日常联系与信息交换，收集整理有关资料和信息,并提供给协会有关部门，负责涉外活动的联系、安排，办理相关手续，会同协会有关部室开展行业对外合作等。

协会组织架构图：